NCIS: Los Angeles — Temporada 6

Callen e Sam estão presos num submarino armado que terroristas apontaram para atingir um porta-aviões em San Diego.

A equipe descobre que um dos seus está comprometido ao investigar a morte de um empreiteiro envolvido em transações ilegais. Hetty é investigada quando o Departamento de Justiça chega a LA.

A equipe protege um dos seus enquanto é interrogada. Nell se disfarça de Hetty, e o diretor Leon Vance conta novidades perturbadoras à Hetty enquanto ela está em Washington.

A equipe descobre ser alvo de alguém do passado e faz uma busca pela cidade. Enquanto isso, o psicólogo operacional Nate Getz visita Nell para ajudá-la a superar a experiência traumática.

Sam vai ao México rastrear o funcionário que conseguiu escapar de um tiroteio no Departamento de Defesa. O restante da equipe trabalha para descobrir o motivo por trás do tiroteio.

Quando Sam é preso por matar uma mulher, Callen e Granger trabalham para limpar o nome dele. Kensi e Deeks descobrem uma ligação entre a vítima e um estudante do passado de Sam.

Quando um homem é morto por um pequeno drone, a equipe descobre a conexão dele com um grupo terrorista que planeja outro ataque local.

Kensi e Deeks se disfarçam para investigar a morte de um desabrigado que era ex-fuzileiro naval e agente da CIA e descobre a ligação dele com o cartel mexicano.

Quando Granger é envenenado por um agente duplo e Eric é um dos sete suspeitos, Hetty ordena um isolamento enquanto todos são investigados.

Sam reflete sobre sua própria educação e relacionamento com seu pai quando a equipe investiga as mortes de fuzileiros que têm filhos em academias militares.

A equipe investiga um assalto a uma empresa cibernética, mas Callen fica longe quando Hetty revela que a namorada dele é testemunha. A equipe discute planos de viagem para o feriado.

Enquanto Callen está disfarçado na sala de correspondências de um prédio de escritórios para investigar um traficante de armas, a sala é invadida por terroristas e Callen se torna refém.

A embaixadora dos EUA escapa de um ataque ao Consulado na Tunísia, Callen e Sam são mandados numa missão para obter provas. A equipe busca o auxílio de Kelly para obter informações.

Callen e Sam se disfarçam como donos de food trucks no México para encontrar a fonte de um envenenamento por Anthrax antes que seja usado para criar uma arma biológica.

Callen e Sam são sequestrados quando seguem uma pista sobre um agente da NSA. Quando a equipe descobre, percebem que poderia ser uma armadilha.

Callen e Sam recebem a missão de apreender um espião, Sam leva um tiro e a equipe pede ajuda a um soldado de elite nepalês para encontrar o atirador. Kensi e Deeks têm sua primeira briga.

A equipe investiga a morte de um soldado afegão e deve encontrar outros dois antes que revelem operações. Sam volta ao trabalho, a equipe teme que seja cedo, Callen percebe eles são diferentes.

Três agentes do FBI são mortos numa explosão e a equipe busca o culpado. Deeks e Kensi percebem que a equipe sabe sobre eles. Hetty põe Kensi com Sam e Deeks com Callen na investigação.

Um míssil é raptado e tirado de curso, a equipe sai em busca do grupo responsável pelo ataque com a ajuda de um jovem especialista em computação que Hetty traz para auxiliar a equipe.

Callen e Sam retomam suas identidades de disfarce como prisioneiro e guarda para se infiltrarem num grupo de supremacistas brancos que se acredita ter a posse de material nuclear roubado.

Callen e Sam ficam chocados quando um velho conhecido, que eles achavam que havia sido vítima recente de um assassinato, aparece e pede a ajuda deles.

A equipe procura por um ex-fuzileiro e atirador que escapou de um hospital quando descobre a ligação dele com o líder de um grupo extremista. O caso lembra a Kensi de seu passado.

Callen e Sam procuram respostas quando encontram membros da equipe do veículo desaparecido, usado no acordo de Arkady, e também descobrem a ligação pessoal de Arkady com o navio.

O caso envolvendo Arkady e sua ligação com um veículo agora leva Callen, Sam, Deeks e Kensi a Moscou. A equipe deve assumir várias identidades de disfarce para localizar seus suspeitos.