Kyle XY — Temporada 2

A cada dia que passa Nicole fica mais triste com a ausência de Kyle e para tentar dar uma relaxada, ela e o marido decidem viajar. Aproveitando-se da situação, Josh dá uma festa para os amigos de escola.

Após o assassinato de Adam Baylin, Kyle não vê mais motivos para ficar afastado dos Tragers e com muito esforço ele convence Foss a deixá-lo morar, novamente, na casa que aprendeu chamar de lar.

Kyle descobre toda verdade sobre seu passado e, com a ajuda de Foss, além de desenvolver suas habilidades, ele também tem que se preocupar de como as usará para ajudar as pessoas.

Determinado em explorar e desenvolver seu potencial, Kyle pretende fortalecer mente e corpo e assim ajudar as pessoas sem se prejudicar.

Apesar de ter salvado Amanda de um invasor, Kyle e a amiga ainda não estão numa boa. Enquanto Stephen desconfia que Josh está fazendo uso de drogas ilícitas, Emely consegue introduzir Jessi, a Cobaia XX, na vida dos Tragers.

Após ter uma visão reveladora, Kyle prevê que algo de muito ruim iria acontecer e, para surpresa de todos, em poucos segundos um terremoto abala a cidade.

Após o inexplicável sumiço de Foss, Kyle passa dedicar mais tempo a sua vida pessoal e aceita o convite de ir ao baile da primavera com Amanda.

O ataque a Lori causa reações bem diferentes aos homens da família Tragers; enquanto Kyle e Stephen só querem protegê-la, Josh quer descobrir e punir quem bateu em sua irmã.

Sem dar explicações, Foss reaparece e jura inocência, porém Kyle não pretende lhe dar uma nova chance. Lori convence todos a irem com ela até a floresta, mais precisamente ao local aonde o caçador foi morto.

Enquanto Josh só pensa em ajudar Andy, Julian está bem contente com os resultados de seu plano de desestabilizar a família Trager.

Os Tragers vão participar de um evento beneficente. Apesar de estarem indo por lados bem diferentes, tanto Kyle como Nicole estão bem perto de descobrirem toda a verdade sobre Jessi.

Após o incidente com Kyle, Jessi descobre toda verdade e foge. Ao saber que Jessi a atacou, Lori passa o tempo todo pensando em como se vingar.

Kyle encontra Jessi e, mesmo sabendo de todo perigo que está correndo, ele está disposto a arriscar tudo para ajudá-la. Embora magoados, Nicole e Stephen estão trabalhando juntos para descobrir toda verdade sobre Kyle, Jessi e Madacorp.

Depois de ser enganado por Jessi e descobrir a verdade sobre Adam, Kyle volta para casa e conta toda a verdade para os Tragers. Num primeiro momento, ele se sente aliviado, mas logo depois vem a angústia.

Quando Jessi descobre que Taylor é seu pai biológico, ela vai morar com ele. Apesar de todo constrangimento, o inevitável acontece e Jessi reencontra os Tragers.

Amanda faz uma grande surpresa e volta para casa para comemorar o aniversário de sua mãe. Ao dizer a Kyle que precisam conversar, ela cria no namorado uma grande expectativa.

Amanda desobedece sua mãe e vai pedir abrigo para Kyle, que, mesmo de castigo e sabendo que não está fazendo a coisa certa, a deixa passar a noite em sua casa.

Depois de fazer um acordo com sua mãe, Amanda começa a trabalhar e, para lhe passar confiança, Kyle aparece em seu primeiro dia de trabalho.

Obcecados por resultados a curtíssimo prazo, Taylor e Jessi estão ultrapassando todos os limites sem se preocuparem com os efeitos colaterais.

Bem agora que todos "precisam" de sua ajuda, Kyle além de passar por um momento delicado só pensa em ficar sozinho com Amanda.

Com muito esforço, Josh consegue ótimos resultados nas últimas provas, porém o diretor Hooper o acusa de participar de um esquema que fraudou os últimos testes. Indignado com a calúnia, ele só quer provar sua inocência.

Kyle encontra Sarah e ela expõe ao garoto todos os perigos que a sua filha corre caso continue sobre a influência de Taylor. Sarah também pede que Kyle a proteja e não conte a ninguém que está viva.

Enquanto Adam se despede de Kyle com a promessa de um dia retornar, Jessi, mesmo contrariada, aceita acompanhar sua mãe e se mudar de cidade.